Melatonina w organizmie człowieka pełni szalenie ważną rolę. Wykazuje się umiejętnościami neutralizującymi działalność wolnych rodników, chroniąc tym samym przed uszkodzeniami, do jakich może dojść na skutek aktywności komórek nowotworowych. Badania wykazały, że związek przyspiesza procesy obumierania komórek rakowych, chroniąc tym samym przed przerzutami.
Coraz częściej mówi się o tym, że przyczyną zwiększonej zachorowalności na nowotwory jest niedobór melatoniny w organizmie, do której dochodzi na wskutek pojawienia się sztucznego oświetlenia. Niegdyś już o zmroku szyszynka zaczynała produkcję hormonu. Dziś hamujemy ten proces, wprowadzając zachwiania w naturalnym rytmie okołodobowym. Teorię o związku między niedoborem melatoniny a powstawaniem nowotworów potęguje fakt, iż starsi ludzie, u których produkcja hormonu odbywa się w minimalnych ilościach, częściej stanowią grupę ryzyka zapadalności na nowotwory.
Melatonina okazuje się skutecznym sposobem walki z nowotworami również dlatego, że wzmacnia układ immunologiczny organizmu. Odporność człowieka maleje wraz z wiekiem. Zmniejszeniu ulega liczba komórek, które w decydującym stopniu chronią przed nowotworami i przerzutami. Hormon wywiera dobroczynny wpływ również na układ krwionośny organizmu, obniżając poziom złego cholesterolu, a także regulując ciśnienie we krwi. Pozytywne efekty działalności melatoniny zauważalne są również w układzie pokarmowym, poprzez spowalnianie procesów trawiennych, dzięki czemu większa ilość cennych dla organizmu witamin i składników mineralnych może ulec wchłonieniu. W szczególności na uwagę zasługuje przyswajalność cynku, którego niewystarczająca ilość w organizmie powoduje niekorzystne skutki w układzie odpornościowym.
Melatonina okazuje się dobroczynnym hormonem w walce z niechcianymi kilogramami. Jej specyficzne właściwości kontrolują wielkość oraz aktywność tkanki tłuszczowej, redukując wagę, nawet bez wprowadzania diety. Tego typu efekty zaobserwowano jak na razie w badaniach na zwierzętach. Póki co, nie potwierdzono ich na ludziach. Badania kliniczne, którym poddano zwierzęta, wykazały również, że niedobór melatoniny powoduje nietolerancję glukozy oraz oporność na insulinę. Tego typu symptomy są również zauważalne na osobach, u których istnieje zmniejszona ilość związku chemicznego we krwi. Mowa o pracownikach pracujących w systemie zmianowym, osobach starszych czy z rozpoznaną cukrzycą. Zauważono również, że melatonina odpowiedzialna jest za stymulację leptyny, która odpowiada za procesy zmniejszające apetyt.